Palazzo Arcivescovile: è situato ad est della Piazza del Duomo, e più precisamente in piazza Arcivescovile, edificato nel quindicesimo secolo di cui splendida è la facciata. All'interno del palazzo si possono trovare magnifici affreschi barocchi, sculture senza tempoe un grande archivio dell'Arcidiocesi di Pisa. Al piano terra si trovano anche una semplice ma suggestiva cappella privata.
Palazzo Alliata: questo splendido palazzo si trova sul Lungarno Gambacorti, angolo con la via Mazzini, in zona centro. Il palazzo è nato unendo più costruzioni risalenti al medioevo, più precisamente fra l'XI e il XII secolo. Di particolare importanza artistica è certamente la facciata composta da piedriti in pietra verrucana.
Casino dei Nobili: si tratta di uno degli edifici più eleganti di tutta Pisa, situato in via Notari. Anch'esso è frutto di un inglobamento di più edifici già esistenti in passato, oltre ad una torre risalente all'unidicesimo secolo. Il palazzo presenta un portico davvero splendido situato naturalmente al piano terreno, mentre al primo piano si trova una grande terrazza con balaustra.

Altri palazzi di notevole interesse storico architettonico: Palazzo Alliata, Palazzo Agonigi da Scorno, Palazzo Agostini Fantini Venerosi della Seta, Palazzo Arcivescovile, Palazzo Cevoli, Palazzo del Torto, Palazzo Gambacorti: sede dell'Amministrazione comunale, Palazzo Lanfranchi sede del Museo della Grafica, Palazzo Medici o Appiano, Palazzo Mosca, Palazzo Giuli Rosselmini Gualandi sede della Fondazione Cassa di Risparmio di Pisa, Palazzo Poschi, Palazzo Quarantotti, Palazzo Reale sede della Soprintendenza, Palazzo Roncioni, Palazzo Salviati, Palazzo della Sapienza: sede principale dello Studio Pisano, Palazzo Tobler, Palazzo Tobler sul Lungarno, Palazzo Toscanelli: da qui Lord Byron partì alla volta della Grecia ove trovò la morte, Palazzo delle Vedove, Torre Guelfa, Torre di Santa Maria, Torre del Campano, Torre De Cantone, Torre Lanfreducci, Palazzo alla Giornata o Lanfreducci sede del Rettorato dell'Università di Pisa, Torre del Lungarno Pacinotti, Torre di Sant'Agnese, Torri di via Cavalca, Torre dei Visconti, Casa torre di via Ulisse Dini, Casa Agostini della Seta, Casa Gualandi, Casa Miniati, Casa del Nero, Casa Pierucci, Casa Rasponi dalle Teste, Casa Tizzoni, Casa Vanni, Villa Roncioni (località Pugnano), Villa Medicea di Coltano (località San Piero a Grado), Villa Agostini della Seta (località Corliano)